Родился в 1955 г. в Берлине в семье лютеранского пастора. В возрасте 14-ти лет в первый раз стал руководителем церковного хора.  По окончании специальной музыкальной школы поступил в Берлинскую высшую школу музыки имени Эйслера по специальностям альт, фортепиано и композиция. Закончил Высшую школу в 1979 году. С 1979 г. и по настоящее время – альтист в оркестре Государственной Оперы (Staatskapelle Berlin), главный дирижер оркестра - Даниэль Баренбойм.

В молодости принял Православие. В 1975 г. по приглашению митрополита Филарета (Вахромеева) стал регентом церкви прп. Сергия Радонежского в Берлин-Карльсхорсте, с 1994 г. – регент кафедрального Воскресенского собора в Берлине.

М. Вильке исполняет музыку XVII -XVIII вв. в различных ансамблях в качестве клавесиниста и органиста.