Ансамбль основан по благословению митрополита Новгородского и Старорусского Льва в 2008 году при Новгородском Духовном Училище. Тогда ансамбль носил название «Мужской хор Новгородского Духовного Училища». В состав коллектива вошли студенты и преподаватели Училища. В обязанности ансамбля всегда входило сопровождение митрополита Новгородского  в богослужебных поездках по митрополии. С 2021 года ансамбль переименован в «Мужской хор духовенства Новгородской епархии».

Регент ансамбля диакон Андрей Валерьевич Кауров. 

Видеозапись Богослужения с участием Ансамбля «Мужской хор духовенства Новгородской епархии»